Первоначальный взнос в виде материнского капитала Вы сможете использовать, если ипотечный кредит будет оформляться на Вас, и Вы будите собственниками покупаемой квартиры, так как покупателем квартиры будет бабушка- она не имеет отношения к Вашей семье, соответственно и не имеет права на распоряжение материнским капиталом.
Ждите получения квартиры-потом купите с привлечением мат капитала, или же ищите альтернативные средства на первоначальный взнос, например воспользуйтесь потребительским кредитом.