Добрый вечер!
1) Стандарта никакого нет. Ситуации на сделках все разные.
2) Верно.
3) Можно указать: "продавец обязуется освободить квартиру от принадлежащего ему имущества и передать квартиру покупателю по акту в течение одного дня со дня получения (или в день получения) сторонами документов из Росреестра"

0,1%, 0,05% за каждый день просрочки.

Это опять предмет договоренности сторон. Можете в процентах от цены договора, можете обозначит конкретную сумму. Главное, чтобы в разумных пределах было.

А какой размер штрафных санкций за каждый день просрочки даты физического освобождения уместно прописать или это опять предмет договоренностей?

Интересно получается: освободить квартиру, не будучи быть уверенным, что право на собственность Покупателя будет зарегистрировано, получено свидетельство. Акт приема-сдачи стороны оформляют после получения Покупателем свидетельства. (форма по договоренности), считаю, это является ущемлением прав Продавца, но, тем не менее, всё прописывается в ДКП.

пункт этот выглядит так
ПРОДАВЕЦ обязуется в течение 1 (Одного) календарного дня с момента государственной регистрации права собственности на имя ПОКУПАТЕЛЯ в Управлении Федеральной службы государственной регистрации, кадастра и картографии по Москве передать ПОКУПАТЕЛЮ КВАРТИРУ в качественном и пригодном для проживания состоянии, отвечающую установленным санитарным и техническим требованиям, не обремененную задолженностями по коммунальным платежам, оплате за электроэнергию и т.д.

Физическое освобождение квартиры происходит в соответствии со сроками, указанными в ДКП. В Московской области иногда требуют при регистрации перехода права в Росреестр передаточный акт. (Свежий пример: в апреле 2016 года, в Истре)

Просчитывайте риски, а вдруг приостановка или отказ в регистрации....??? а Вы уже въехали....

В договоре по освобождению квартиры можно писать все, что захотите. Но это двухсторонний договор! Одного Вашего желания мало. Если сделка состоит из цепочки квартир, то только по согласованию сторон просчитываются и прописываются все сроки освобождения.

1 .Это зависит от договоренностей сторон.
2. Да.
3. Можно. И даже ждать регистрации для этого нет необходимости. Квартиру можно передать и при подписании договора купли-продажи.